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长期以来，由于现存稻属中不存在二倍体DD物种，科学界主要依赖异源四倍体中的DD亚基因组开展研究。此前，研究人员对EE与DD基因组分化时间和亲缘关系的认识仍存在争议。同时，受复杂重复区域限制，已有澳洲野生稻基因组研究均未达到完整无缺口水平，着丝粒、端粒等关键区域信息缺失，制约了对其演化机制的深入认识。